Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCSER2Q9H7U1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCSER2Q9H7U1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCSER2Q9H7U1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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