Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLSTN2Q9H4D0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLSTN2Q9H4D0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CLSTN2Q9H4D0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms