Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SHARPINQ9H0F6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SHARPINQ9H0F6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SHARPINQ9H0F6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms