Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ROPN1BQ9BZX4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1BQ9BZX4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1BQ9BZX4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms