Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RTN4RQ9BZR6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms