Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSDMCQ9BYG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSDMCQ9BYG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms