Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL4Q9BYD3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL4Q9BYD3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MRPL4Q9BYD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MRPL4Q9BYD3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.5 ms