Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SERAC1Q96JX3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SERAC1Q96JX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SERAC1Q96JX3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SERAC1Q96JX3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms