Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFWD2Q8NHY2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFWD2Q8NHY2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFWD2Q8NHY2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFWD2Q8NHY2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms