Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM42Q8IWZ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM42Q8IWZ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms