Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH18Q13634 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH18Q13634 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH18Q13634 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH18Q13634 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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