Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPOCK1Q08629 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SPOCK1Q08629 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPOCK1Q08629 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPOCK1Q08629 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms