Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 GPI2YPL076W 843 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 PBP2YBR233W 1242 nt6.87□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 ARP3YJR065C 1350 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 snR56snR56 88 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 FBA1YKL060C 1080 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 TAF9YMR236W 474 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YNL017CYNL017C 339 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YNL120CYNL120C 486 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YNL171CYNL171C 369 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 MSO1YNR049C 633 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YOL050CYOL050C 321 nt6.86□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 SPO77YLR341W 1434 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 CLB4YLR210W 1383 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 BI2Q0110 1272 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YLL047WYLL047W 384 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YLR271WYLR271W 825 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YMR144WYMR144W 1029 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YGP1YNL160W 1065 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 RUF23RUF23 254 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 TLG2YOL018C 1194 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 PRP40YKL012W 1752 nt6.85□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 MST1YKL194C 1389 nt6.84□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 THI2YBR240C 1353 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 ECM38YLR299W 1983 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 BDF2YDL070W 1917 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 VHS2YIL135C 1311 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YDR336WYDR336W 945 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YFR045WYFR045W 930 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 RRP46YGR095C 672 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 CTF8YHR191C 402 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 COG5YNL051W 1212 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YNL194CYNL194C 906 nt6.84□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF3Q07807 RUF5-1RUF5-1 710 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 RUF5-2RUF5-2 710 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 YPL257WYPL257W 582 nt6.84□□□□□ -1.31
PUF3Q07807 CCC2YDR270W 3015 nt6.83□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 AGP2YBR132C 1791 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 FAL1YDR021W 1200 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YGL218WYGL218W 651 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 ERV29YGR284C 933 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YKL091CYKL091C 933 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YML090WYML090W 387 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 MRPS18YNL306W 654 nt6.83□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 HRT1YOL133W 366 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 SAL1YNL083W 1485 nt6.83□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 BUD9YGR041W 1644 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 PMT3YOR321W 2262 nt6.83□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 RPN5YDL147W 1338 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 MSY1YPL097W 1479 nt6.82□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 NBP2YDR162C 711 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 RPP1YHR062C 882 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 SQT1YIR012W 1296 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 LYS1YIR034C 1122 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 SPC42YKL042W 1092 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YBR134WYBR134W 402 nt6.82□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 PEX3YDR329C 1326 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YDL114WYDL114W 927 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YAP6YDR259C 1152 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 VMA3YEL027W 483 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 PHM8YER037W 966 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YFR057WYFR057W 456 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 HGH1YGR187C 1185 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 SAY1YGR263C 1275 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 DID2YKR035W-A 615 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YAL064WYAL064W 285 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 PRP9YDL030W 1593 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 SES1YDR023W 1389 nt6.81□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 AIM3YBR108W 2844 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 APM4YOL062C 1476 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 GLE1YDL207W 1617 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 DPB2YPR175W 2070 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 DUO1YGL061C 744 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YGL101WYGL101W 648 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YOL162WYOL162W 648 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 ELP3YPL086C 1674 nt6.8□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 LUC7YDL087C 786 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 GCG1YER163C 699 nt6.79□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 QCR6YFR033C 444 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 HEM2YGL040C 1029 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 MPM1YJL066C 759 nt6.79□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 ERG20YJL167W 1059 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.79□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 BLS1YLR408C 369 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 COX5AYNL052W 462 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 MFA2YNL145W 117 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YFL052WYFL052W 1398 nt6.79□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 POX1YGL205W 2247 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 GDA1YEL042W 1557 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 UTR2YEL040W 1404 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 ADK2YER170W 678 nt6.78□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 OM45YIL136W 1182 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YIR043CYIR043C 693 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 YUH1YJR099W 711 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 CCE1YKL011C 1062 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 JNM1YMR294W 1122 nt6.78□□□□□ -1.32
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