Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CKAP4Q07065 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP4Q07065 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP4Q07065 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms