Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HBBP68871 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HBBP68871 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HBBP68871 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HBBP68871 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HBBP68871 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HBBP68871 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HBBP68871 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HBBP68871 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HBBP68871 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HBBP68871 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HBBP68871 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HBBP68871 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HBBP68871 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HBBP68871 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HBBP68871 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HBBP68871 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HBBP68871 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HBBP68871 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HBBP68871 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HBBP68871 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HBBP68871 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms