Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCBP4P57723 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCBP4P57723 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms