Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18A1P54219 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18A1P54219 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms