Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PHKA1P46020 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PHKA1P46020 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PHKA1P46020 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PHKA1P46020 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms