Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GARSP41250 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARSP41250 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARSP41250 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARSP41250 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARSP41250 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GARSP41250 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GARSP41250 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARSP41250 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GARSP41250 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GARSP41250 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GARSP41250 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GARSP41250 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GARSP41250 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARSP41250 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARSP41250 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARSP41250 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARSP41250 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GARSP41250 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GARSP41250 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GARSP41250 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GARSP41250 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GARSP41250 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GARSP41250 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GARSP41250 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GARSP41250 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARSP41250 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARSP41250 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARSP41250 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GARSP41250 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GARSP41250 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GARSP41250 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms