Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIK1P39086 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRIK1P39086 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK1P39086 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms