Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 RNR3YIL066C 2610 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 BUG1YDL099W 1026 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 VCX1YDL128W 1236 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 YKL102CYKL102C 306 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 SCP1YOR367W 603 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 PTC4YBR125C 1182 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 YLL067CYLL067C 3618 nt5.09□□□□□ -1.59
MSK1P32048 YEH1YLL012W 1722 nt5.09□□□□□ -1.6
MSK1P32048 NUP1YOR098C 3231 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 IDP1YDL066W 1287 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 NPA3YJR072C 1158 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SCS7YMR272C 1155 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 MSO1YNR049C 633 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YOR268CYOR268C 399 nt5.08□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ROG3YFR022W 2202 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ILV1YER086W 1731 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YJL171CYJL171C 1191 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SRY1YKL218C 981 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 TAF11YML015C 1041 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 MED4YOR174W 855 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 CCZ1YBR131W 2115 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 VTC2YFL004W 2487 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 NOP2YNL061W 1857 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YEF1YEL041W 1488 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 WHI2YOR043W 1461 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ENT2YLR206W 1842 nt5.07□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ASH1YKL185W 1767 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 FLC3YGL139W 2409 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 HST3YOR025W 1344 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 AAP1YHR047C 2571 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YDL057WYDL057W 987 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 PPH21YDL134C 1110 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 UPS3YDR185C 540 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 IPK1YDR315C 846 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SIP2YGL208W 1248 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YHR095WYHR095W 495 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YJU3YKL094W 942 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 RPS3YNL178W 723 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 RET1YOR207C 3450 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SPC97YHR172W 2472 nt5.06□□□□□ -1.6
MSK1P32048 VNX1YNL321W 2727 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ECM3YOR092W 1842 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 HMLALPHA1YCL066W 528 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 MATALPHA1YCR040W 528 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YLR122CYLR122C 378 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YOL046CYOL046C 675 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 CST6YIL036W 1764 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 MNN2YBR015C 1794 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 GLE1YDL207W 1617 nt5.05□□□□□ -1.6
MSK1P32048 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 RFA2YNL312W 822 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 PAU21YOR394W 495 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 PAU22YPL282C 495 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SUE1YPR151C 621 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 RFA1YAR007C 1866 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SRV2YNL138W 1581 nt5.04□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ERC1YHR032W 1746 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 UGO1YDR470C 1509 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 CLP1YOR250C 1338 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 SMF2YHR050W 1650 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 HAP2YGL237C 798 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 RME1YGR044C 903 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YHM2YMR241W 945 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ERI1YPL096C-A 207 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ACC1YNR016C 6702 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 PPR1YLR014C 2715 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 ERG7YHR072W 2196 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 CLB4YLR210W 1383 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 COR1YBL045C 1374 nt5.03□□□□□ -1.6
MSK1P32048 YPK2YMR104C 2034 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 YEA6YEL006W 1008 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 RPS2YGL123W 765 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 YJL193WYJL193W 1209 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 YLR317WYLR317W 435 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 SML1YML058W 315 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 OXP1YKL215C 3861 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 ZWF1YNL241C 1518 nt5.02□□□□□ -1.61
MSK1P32048 TAH18YPR048W 1872 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 RTT103YDR289C 1230 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 YER186CYER186C 921 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 FPR3YML074C 1236 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 MTF1YMR228W 1026 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 RHO2YNL090W 579 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 HSF1YGL073W 2502 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 YAP1801YHR161C 1914 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 RGT1YKL038W 3513 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 FHL1YPR104C 2811 nt5.01□□□□□ -1.61
MSK1P32048 QDR3YBR043C 2070 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 PTC3YBL056W 1407 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 VAM7YGL212W 951 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 SOD2YHR008C 702 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 RIB1YBL033C 1038 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 HEM15YOR176W 1182 nt5□□□□□ -1.61
MSK1P32048 MCM3YEL032W 2916 nt5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.2 ms