Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALRP27797 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALRP27797 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALRP27797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALRP27797 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALRP27797 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALRP27797 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALRP27797 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALRP27797 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALRP27797 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALRP27797 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALRP27797 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALRP27797 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALRP27797 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALRP27797 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALRP27797 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CALRP27797 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CALRP27797 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALRP27797 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALRP27797 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALRP27797 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALRP27797 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CALRP27797 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALRP27797 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CALRP27797 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CALRP27797 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALRP27797 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALRP27797 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms