Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZKSCAN1P17029 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZKSCAN1P17029 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ZKSCAN1P17029 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
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