Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KDM4AO75164 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM4AO75164 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM4AO75164 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms