Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SERPINE3A8MV23 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SERPINE3A8MV23 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SERPINE3A8MV23 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms