Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
C9orf170A2RU37 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
C9orf170A2RU37 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C9orf170A2RU37 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms