Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNC2Q96PR1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC2Q96PR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC2Q96PR1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms