Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
C8orf49Q96NF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf49Q96NF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms