Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM47Q96LD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM47Q96LD4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM47Q96LD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms