Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VSIG2Q96IQ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VSIG2Q96IQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms