Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHD5Q8TDI0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHD5Q8TDI0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHD5Q8TDI0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms