Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEK9Q8TD19 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NEK9Q8TD19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEK9Q8TD19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEK9Q8TD19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms