Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LINC01555Q8NAE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINC01555Q8NAE3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINC01555Q8NAE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms