Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3DQ7Z6J8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE3DQ7Z6J8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBE3DQ7Z6J8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms