Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SOHLH1Q5JUK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SOHLH1Q5JUK2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms