Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MRE11P49959 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MRE11P49959 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MRE11P49959 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRE11P49959 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MRE11P49959 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MRE11P49959 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MRE11P49959 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MRE11P49959 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MRE11P49959 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MRE11P49959 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRE11P49959 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRE11P49959 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MRE11P49959 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MRE11P49959 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRE11P49959 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRE11P49959 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRE11P49959 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MRE11P49959 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MRE11P49959 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MRE11P49959 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRE11P49959 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MRE11P49959 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MRE11P49959 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MRE11P49959 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MRE11P49959 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 431.2 ms