Protein–RNA interactions for Protein: P35998

PSMC2, 26S proteasome regulatory subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC2P35998 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC2P35998 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PSMC2P35998 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC2P35998 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMC2P35998 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms