Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALRP27797 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALRP27797 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALRP27797 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALRP27797 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALRP27797 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALRP27797 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALRP27797 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALRP27797 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALRP27797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALRP27797 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALRP27797 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CALRP27797 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALRP27797 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALRP27797 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALRP27797 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CALRP27797 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CALRP27797 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CALRP27797 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALRP27797 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALRP27797 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CALRP27797 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALRP27797 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALRP27797 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALRP27797 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALRP27797 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALRP27797 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALRP27797 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALRP27797 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALRP27797 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CALRP27797 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms