Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPN3P26045 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPN3P26045 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPN3P26045 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms