Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM27P14373 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TRIM27P14373 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
TRIM27P14373 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM27P14373 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms