Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IFITM1P13164 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms