Protein–RNA interactions for Protein: P08253

MMP2, 72 kDa type IV collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP2P08253 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP2P08253 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP2P08253 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP2P08253 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP2P08253 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP2P08253 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP2P08253 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP2P08253 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP2P08253 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP2P08253 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP2P08253 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP2P08253 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP2P08253 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP2P08253 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP2P08253 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP2P08253 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP2P08253 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP2P08253 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP2P08253 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP2P08253 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP2P08253 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP2P08253 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP2P08253 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP2P08253 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP2P08253 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP2P08253 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP2P08253 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP2P08253 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP2P08253 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP2P08253 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP2P08253 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP2P08253 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP2P08253 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMP2P08253 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.2 ms