Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB6O95452 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB6O95452 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB6O95452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB6O95452 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB6O95452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB6O95452 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB6O95452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB6O95452 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB6O95452 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB6O95452 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB6O95452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB6O95452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB6O95452 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB6O95452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB6O95452 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB6O95452 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB6O95452 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB6O95452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB6O95452 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB6O95452 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB6O95452 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB6O95452 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB6O95452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB6O95452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJB6O95452 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJB6O95452 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJB6O95452 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB6O95452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB6O95452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB6O95452 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJB6O95452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 575.1 ms