Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRDM1O75626 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRDM1O75626 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRDM1O75626 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms