Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
N4BP1O75113 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
N4BP1O75113 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
N4BP1O75113 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms