Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRTM2O43300 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRTM2O43300 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRTM2O43300 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms