Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
J3QQQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
J3QQQ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
J3QQQ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
J3QQQ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
J3QQQ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
J3QQQ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QQQ9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QQQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QQQ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QQQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
J3QQQ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
J3QQQ9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
J3QQQ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
J3QQQ9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3QQQ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms