Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VWA8A3KMH1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VWA8A3KMH1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VWA8A3KMH1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VWA8A3KMH1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms