Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMEM223A0PJW6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms