Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
A0A0D9SFI3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
A0A0D9SFI3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
A0A0D9SFI3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A0A0D9SFI3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
A0A0D9SFI3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms